A estrutura de inovação das empresas de educação é afetada por diversos fatores. O primeiro deles é a disponibilidade de recursos financeiros. Sem recursos financeiros suficientes, as empresas de educação não conseguem investir em novas tecnologias e processos inovadores. Além disso, a disponibilidade de talentos qualificados também é um fator importante. Sem profissionais qualificados, as empresas de educação não conseguem desenvolver e implementar novas ideias e soluções inovadoras.
Outro fator importante é a cultura organizacional. Uma cultura organizacional inovadora incentiva os funcionários a pensar de forma criativa e a buscar soluções inovadoras para os problemas. Por fim, a estrutura de inovação das empresas de educação também é afetada pela regulamentação. A regulamentação pode limitar ou incentivar a inovação, dependendo de como é aplicada.